昌宁县境内有五柱茶、大理茶、滇缅茶、云南普洱茶、茶、秃房茶等六个组系分布。在其6个乡镇境内均保持有大量的野生茶树及茶的近缘植物，其中乔木型野生茶有箐茶、宝洪茶、黑条子茶等灌木型野生茶有菜花茶等，近缘植物有云南山茶、油茶、大头茶等。其中推广运用面积较大的品种有：地方性群体良种漭水源头种、温泉源头茶、昌宁大叶种茶、石垭口小茶、宝丰大叶种茶等；国家级无性系良种云抗10号、佛香1-3号等；地方性无性良种昌选1-3号、风引、香归系列、凤庆9号、金萱、紫娟、长叶白毫等。红茶绿茶普洱就普遍了。

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